中高一貫教室12クラス、高校教室24クラス、計36クラスからなる教室棟は中高一貫ゾーン3階建て、高校ゾーン4階建になり、中高・高校それぞれ各階にゼミ室を設けている。
　また、常に生徒と教師が身近に交流できるように教官室を設け生徒の相談や質問に対応できるように配慮した。各教室ゾーンにある吹き抜け階段（コア）は各階のつながりだけでなく、上下階の交流を生み出し、採光・通風を通す装置として機能している。各教室の廊下にスタディースペースとして空間を広く設けており、様々な授業スタイルに対応し、生徒の自主学習に活用できる。
　2008年度の竣工当初は中高一貫教室に余裕ができるため、1階エントランス近くの1教室を中高一貫職員室として利用している。